摘要

一种用于清算协议系统评估的质量度量

光板成像指南,以实现单细胞分辨率的清除3D多细胞球状体和类器官

3D多细胞球状体对于研究肿瘤行为和评价药物活性药物的反应很有兴趣,因为它们比标准的2D细胞培养物更好地模拟体内肿瘤环境。然而,尽管球状体具有生物学上的优势,但在目前的显微镜下,在大型三维球状体的最内层观察单个细胞仍然是一个挑战,这主要是由于光散射导致穿透性差。

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这些困难可以通过结合荧光光片显微技术和光学澄清方法来克服。在最近的一项研究中,比较了评估清算协议效率的几个指标。当用SP8分析多细胞聚集物时达到单细胞分辨率的成像指南DLS并介绍了显微镜系统。

其中的一个DLS主要优点是便于对样品进行两面照明。我们分析了来自3种不同细胞系的直径约250µm的球状体,并使用5种不同的清除方案可视化了其内部的细节。完整的3D数据集,其中包括90个荧光染色的球体,已经与社区共享。为了表征球状体、类器官或其他三维多细胞聚集物的图像质量,提出了一种新的度量。该度量可以作为光学澄清协议的定量比较的黄金标准,并帮助用户选择最适合任何给定的实验。

阅读全文:

A Diosdi, D Hirling, M Kovacs, T Troth, M Harmati, K Koos, K Buzas, F Piccinini, P Horvath:

三维多细胞球体的光学澄清协议的比较评价的定量度量

计算与结构生物技术,19:1233-1243,2021年2月。DOI: 10.1016 / j.csbj.2021.01.040

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021000441

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