故事

如何通过激光微量分配改善DNA突变分析工作流程

癌症研究:提取未稀释的癌组织进行DNA突变分析

DNA突变导致异常蛋白质或缺失的功能蛋白,其可导致细胞繁殖,并且变得癌变。为了发现和理解特异性癌症类型的潜在突变,纯肿瘤材料的提取非常重要。这是挑战,特别是如果只有有限量的癌组织(例如,小转移)。激光微生物允许提取纯粹的癌组织而不用健康细胞污染样品。DNA测序将导致有效和可重复的结果有助于鉴定癌症,导致DNA突变容易,因为可以发生污染健康细胞的掩蔽。

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具有单细胞精度的DNA突变分析工作流程

徕卡的激光微生物切除系统将通过精确切割您感兴趣的细胞来改善您的工作流程。每一步都处于视觉控制并没有与周围组织污染的污染。

LMD Flyer“DNA突变分析”


DNA分析工作流程 - 步骤

1.样品制备

通常,基于特殊的膜的载玻片用于激光微粉。样品制备LMD.是简单的,并且可以从经典制剂源自组织学。

石蜡嵌入将组织样品带入可以切成薄片的结构中。或者,您可以使用Cryo-Defore来准备幻灯片。如果可用的新鲜癌组织,则优选冷冻切片以保护核酸免于降解。

我们将提供合适的LMD幻灯片对于您的申请。

2.固定和染色

通常可以使用石蜡切片或冷冻切片。在这里,我们将概述冻结部分的使用。

用丙酮,乙醇或乙醇和乙酸的混合物冷冻切片后,应固定并染色样品载玻片。

H&E是一种常见的组织学污渍,其中苏木序染色核,eosin染色细胞质。

H&E染色适用于石蜡和冷冻部分。

3.可视化和ROI定义

徕卡LMD.系统可以生成自动示例概述,可用于容易地导航到您的兴趣区域(ROI)。

您的ROI可以由AVC软件模块自动识别并标记,或者您可以手动应用形状。

4.激光微粉

接下来,通过激光在视觉控制下精确地解剖所定义的ROI,并通过重力直接收集。视觉控制的切除可防止将肿瘤材料与健康细胞混合,扭曲结果。通过重力的集合允许使用标准,具有成本效益消耗品如PCR管或8条带状管。

此外,您可以使用“移动和切割”工具直接剪切您的样品,而没有任何预定义的形状。

我们提供适当的LMD.系统根据您的需求。

5.提取DNA

188金宝搏的网址Leica Microsystems推荐高品质的QIAGEN KITS(QIAAMP®DNA微套件)用于制备核酸。

它们可以立即用于下游应用,例如PCR,测序,定量,实时PCR,或者可以在-20℃下储存直到所需的。

请参阅www.qiagen.com.有关详细信息。

6. DNA突变分析

DNA突变分析通过下一代测序(NGS)进行。

其他技术,如焦点或古典DNA Sanger测序也适用。

典型的研究领域

  • 病理研究
  • 神经科学
  • 药学研究
  • 植物研究
  • 表观遗传学研究

参考

  1. Shen等,自然,2018,Doi:10.1038 / s41586-018-0703-0
  2. Makohon-Moore等人。,Nature,2018,Doi:10.1038 / S41586-018-0481-8
  3. Untch等人,Canceres,2018,Doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-17-1925
  4. 黄等人。纳米替纳洛斯科(2018)

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