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如何通过激光微放置改进您的生物标志物发现工作流程

癌症研究:快速和可重复的生物标志物发现

生物标志物可用作某些疾病的指标,例如癌症。肿瘤微环境在这一问题中进入了聚光灯。它与肿瘤本身密切相互作用。然而,肿瘤和非肿瘤区域之间存在明显的分子差异,以及肿瘤本身。它们只能通过隔离这些区域的特定的分布部分来破译。

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这就是为什么徕卡LMD系统允许集合直接进入下游分析容器,例如PCT Microtubes,用于快速组织均质化,蛋白质提取和消化。

压力循环技术(PCT, PressureBioSciences Inc.)使用高压简化样品制备,用于质谱分析。PCT可以处理LMD在1小时内的样品,三个下方的最大活检组织片。

组合技术允许以高精度和速度分离肿瘤微环境。不同地区的下游分子分析将有意义,因为它们可以单独分析而不是混合物。

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生物标志物发现工作流程,单细胞精度

徕卡的激光微生物切除系统将通过精确切割您感兴趣的细胞来改善您的工作流程。视觉控制下的一切以及无污染周围组织。

下载:飞行者生物标记发现

1.样品制备

通常,基于特殊的膜的载玻片用于激光微粉。样品制备LMD很简单,可以从经典的组织学准备中得到。

对于下游蛋白质组学,我们建议PET膜载玻片(几乎没有软化剂)或导演™允许完全膜消融的载玻片。

石蜡嵌入将组织样品带入可以切成薄片的结构中。或者,您可以使用Cryo-Defore来准备幻灯片。

我们会送合适的LMD幻灯片为您的申请。

2.固定和染色

组织的固定和染色LMD应用可以根据兴趣结构进行应用。这可以包括亮场和荧光染色。

该步骤可以用抛光器自动化。

通常,大多数污渍与下游蛋白质组学相容。尽管如此,它以前值得调查。

3.可视化和ROI

徕卡LMD系统可以生成自动示例概述,可用于容易地导航到您的兴趣区域(ROI)。

您的roi可以由ADM软件模块自动识别和标记,或者您可以手动应用形状。

之前自动侦测

自动检测后

小鼠脑,酸紫罗兰。在神经元的自动检测(ADM)之前和之后。

4.激光微粉

接下来,通过激光在视觉控制下解剖定义的ROI,并通过重力直接收集。

如果需要,在必要时分离癌症材料或任何其他ROI,如果需要,如果需要,在一个或不同的反应容器中。

您可以使用标准消耗品,例如PCR管。或将它们直接收集到下游分析容器中,例如,PCTμTubes(压力生物科学公司)以一种专用的LMD采集设备,请参见下一步。

5.蛋白质准备

可以做到微小样品的均质化,提取和消化物。G。压力循环技术(PCT)从压力Biosciences Inc.之后LMD-pct工作流程,这允许在一小时内肽的快速和可重复的肽(Lee S等人,细胞报告2020,doi.org/10.1016/j.celrep.2020.03.066),节省几个小时,并为微小组织样品提供双样品制备。

有关此工作流程的更多信息,请访问:https://bit.ly/2AXxWdn

6.分析

通过质谱法分析样品并鉴定您的生物标志物。

典型的研究领域

  • 生物标志物发现
  • 癌症研究
  • 个性化的药物
  • 翻译研究
  • 蛋白质组学
  • 代谢组学

参考文献

  1. Lee S等人。,Cell Reports 2020,https://doi.org/10.1016/j.celrep.2020.03.066
  2. Hunt AL等人,Cancer Res 2019;79 doi.org/10.1158/1538-7445.AM2019-4709
  3. Guo T等人。,Nat Med。2015;21:407-13
  4. Shao S等人。,蛋白质组学2015;15:1-11

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