故事

区块上的新存储库

单元格:一个图像库- CCDB

对数据验证和可访问性的需求从未像今天这样强烈。我们被来自大量资源的信息淹没了,但是我们如何能够轻松地评估这些数据的准确性呢?在过去,同行评审过程提供了这一点,通常是由出版商运行的。然而,现在人们可以在万维网上自我发布,我们必须自己去寻找那些可信的、致力于科学准确性的资源。广泛的科学学科在数据的聚集中发现了巨大的好处。早期的蛋白质序列数据库和核苷酸数据库已经被证明对他们的领域是无价的。虽然显微成像领域的发展有点晚,主要是由于围绕大型图像数据集存储的技术问题,但该领域有一个新的参与者。细胞:一个图像Library-CCDB

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细胞带来的价值

作为显微镜图像数据的同行评审数据库,我们提供了必要的监督,以确保只有有效和可信的数据在细胞中呈现。这意味着作为用户的您可以相信您所获得的内容没有受到不当操纵。

此外,在美国有一些资助机构已经要求所有在联邦资助下获得的数据必须公开。想象一下,研究人员开发一个网站来展示他们最终论文中没有的所有图片,需要付出多少努力和基础设施。考虑用户从一个站点移动到另一个站点的体验,每个站点都有自己的导航和搜索,试图访问他们感兴趣的数据。通过向The Cell提交他们的图像,研究人员很容易满足这些要求,并在一个简单易用、一致的系统中提供他们的数据和其他人的数据。

细胞也可以作为一个档案的所有实验的显微镜数据,使实验室和其他可以在未来很容易地参考这些数据。有多少信息存储在硬盘上,埋在桌子上的文件夹下?Cell可以让其他人可以查询这些信息,节省时间和金钱,重复已经做过的实验。科学过程需要共享结果,而细胞提供了共享所有结果的能力,而不仅仅是出现在最终的论文。

此外,作为一个真正的多媒介图书馆,The Cell有能力提供期刊不希望在其补充信息网站上托管的其他视频。因为细胞是一个免费的资源,这些额外的视频将永远可用。

The Cell提供的功能

除了上文提到的the Cell为研究人员提供的价值之外,这个数据库还为用户提供了广泛的功能,无论是研究人员、教育工作者、学生还是公众。

Cell使用Web Image Browser (WIB)。WIB是一种易于使用、直观的方法来探索高分辨率图像。它给用户提供了缩放和查看这些图像中所呈现的细节的能力。使用细胞的其他详细查看器,用户还可以探索4D图像,那些都是一个Z系列和时间系列。

此外,还有一些免费帐户也包含一些有用的功能。有了一个免费的帐户,用户可以定义感兴趣的领域,并返回到细胞,这些感兴趣的领域更新与最近的图像,以便用户有一个定制的主页。一个账户还提供了将照片标记到特定照片框的功能,以便以后方便参考。用户可以根据需要或需要创建和定义任意多个。

Cell有一些非常令人兴奋的功能,计划为这些当前功能的未来发展。用户可以加其他研究人员为好友,并与他们分享照片盒。或者一个想要一组图像来解释有丝分裂的教育者可以和其他教育者共享一个照相箱。在未来,个人订阅可以访问“兴趣领域”和“高级搜索”,当与个人兴趣相匹配的图像被输入系统时,电子邮件会提醒用户正在等待新的图像。

草履虫多小核体-收缩液泡复合体的视频。体内CVC充盈/排出循环。侧视图观察到压缩细胞内的CV,随着CV膜融合,然后从质膜中分离,并伴有一个径向臂,CV的液体内容依次填充(舒张)和排出(收缩期)。电影是由Tomomi Tani博士用附着在徕卡倒置显微镜上的差分干涉对比光学拍摄的。使用Leica Fluotar x63物镜(NA = 0.7)。这段视频是Tomomi Tani和Richard Allen拍摄的。cellimagelibrary.org/images/9692

提交图像的方式

像这样的资源是非常有用的。Cell需要研究人员的参与,不仅是为图书馆做出贡献和使用图书馆,而且还提供可能需要的反馈。

首先,The Cell需要图片——而不仅仅是已经出版的图片(事实上,这些图片通常有版权负担,但The Cell确实与一些出版商有协议)。欲了解更多信息,请参阅许可政策

提交图片请使用细胞在线上传功能对于许多更常见的数据格式。如果有直接来自显微镜的数据或不被在线上传者处理的格式,细胞几乎肯定可以处理它与DataRollup软件.这个过程也可以用于批量提交大量的图像。本软件使用Bio-Formats

加入细胞社区的方法

首先,如果您有任何问题、评论或建议,请联系David Orloff (188金宝搏的网址dorloff@ascb.org),影像库高级经理。

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ASCB欢迎反馈,包括对图书馆改进的建议dorloff@ascb.org

本项目由美国国立卫生研究院国家普通医学科学研究所(NIGMS)授予美国细胞生物学学会的奖励编号RC2GM092708资助。188bet怎么注册

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