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人神经母细胞瘤细胞PPT1相互作用组的定量分析

HyVolution超分辨率应用实例

突变CLN1编码棕榈酰蛋白硫酯酶1 (PPT1)或CLN1的基因导致婴儿NCL(包括,mim# 256730)。PPT1从蛋白质的修饰半胱氨酸残基中去除长脂肪酸链,如棕榈酸盐。这里显示的数据来自表达ppt1的SH-SY5Y稳定细胞的分离蛋白复合物,这些复合物通过单步亲和纯化结合质谱(AP-MS)得到。在进行质谱分析之前,我们使用了改良的过滤器辅助样品制备(FASP)方案。依据无标签的数据进行定量分析圣人,发现了23个PPT1互作伙伴(IP)。功能耦合和扩展网络分析进一步揭示了PPT1网络的紧密连接,将其与线粒体ATP合成、偶联蛋白运输和硫酯生物合成过程连接起来。此外,PPT1网络中的术语:机体死亡抑制、运动障碍和脂质浓度被预测改变。

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Scifo E, Szwajda A, Soliymani R, Pezzini F, Bianchi M, Dapkunas A, Dębski J, uusii - rauva K, Dadlez M, Gingras AC, Tyynelä L, Simonati A, Jalanko A, Baumann MH, Lalowski M:
人神经母细胞瘤细胞PPT1相互作用组的定量分析

蛋白质组学杂志,第123卷,42-53 (2015)doi:10.1016/j.dib.2015.05.016

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